有关人类灵魂的问题是能在全世界引起多方讨论的神学论题。除了基督教之外的许多宗教都在研究灵魂问题，并且各自作出不同的解释。但是无论到哪里去听，却不能听到没有矛盾的、体系完整的、可以毫无疑问地相信的论文和讲道。
有关灵魂问题的答案可以从圣经中找到。是因为圣经是由创造人类灵魂的创造主上帝所记录的。那么关于灵魂圣经是如何告知我们的呢？在基督来到这地上之前，所记录的旧约圣经就像月光一样朦胧地给我们显明了有关灵魂的真理。相反新约圣经就像白天照射的阳光一样透彻地显明了灵魂问题。
灵魂是肉体的生命或活动力吗？
有些人只研究旧约圣经从而歪曲灵魂的问题。他们主张灵魂是指肉体的生命或活动力，因此说人死后，灵魂也被一起消灭。但是圣经的教导并不是如此。
耶和华上帝用地上的尘土造人，将生气吹在他鼻孔里，他就成了有灵的活人，名叫亚当。 创2章7节
人是由尘土和生气，即肉体和灵魂被创造的。所要关注的是，灵魂并不是随着肉体而产生的，是上帝分开创造的存在。因此人死后，肉体归土，灵魂归于上帝（传12章7节）。因所来的地方不同，所要回去的地方也不同。
如果灵魂只是肉体的生命或活动力，就会得出给予肉身生命的肉身的父亲赐给我们灵魂的这一结论。但是圣经分明见证了既有“肉身的父亲”也有“灵的父亲”。
再者，我们曾有生身的父管教我们，我们尚且敬重他；何况万灵的父，我们岂不更当顺服他得生吗？ 来12章9节
灵的父亲指上帝。灵魂与肉身的父亲无关，是上帝创造的存在。因此圣经见证的灵魂并不是肉身出生时所产生的属于肉体的生命或活动力。而是人死后，也依然单独活着的存在。
虽然肉体死亡，灵魂依然活着
所以耶稣教导说，人虽然可以杀肉体，却无法杀灵魂。
“那杀身体不能杀灵魂的，不要怕他们；惟有能把身体和灵魂都灭在地狱里的，正要怕他。” 太10章28节
约翰和彼得等得到耶稣教导的使徒们，也记录了肉体死后，灵魂也依然活着。
……我看见在祭坛底下，有为上帝的道、并为作见证被杀之人的灵魂，大声喊着说…… 启6章9-11节
他藉这灵曾去传道给那些在监狱里的灵听，就是那从前在挪亚预备方舟、上帝容忍等待的时候，不信从的人……为此，就是死人也曾有福音传给他们，要叫他们的肉体按着人受审判，他们的灵性却靠上帝活着。 彼前3章19-20节、4章6节
使徒约翰通过启示看到了殉教的圣徒们的灵魂与上帝对话。使徒彼得记录了耶稣向挪亚时代因洪水死去的人们的灵魂传播福音。有些人认为死人的灵魂处于无意识的状态，这也不是事实。耶稣向死人的灵魂传播福音的圣经的记录给我们显明了，人死后存在的灵魂具有能够领悟福音并迎接的意识。
灵魂是生命的本质
圣经中肉身的死亡是意味着肉体和灵魂的分离（传12章1-7节）。如果灵魂离开肉体，身体就会死，相反离开身体的灵魂归回，就会活过来。生命的本质并不是肉体，而是灵魂。
……有人从管会堂的家里来，说：“你的女儿死了。”……耶稣说：“不要哭，她不是死了，是睡着了。”……耶稣拉着她的手，呼叫说：“女儿，起来吧！”她的灵魂便回来，她就立刻起来了。耶稣吩咐给她东西吃。 路8章49-55节
像这样，人的灵魂既可以在身体里，也可以离开身体在外面。也就是说与肉体无关，也可以独自存在。使徒保罗反复2次提及到，离开身体也能存活的灵魂的存在（林后12章2-3节）。此外还见证了圣徒们的死亡意味着“离开身体去基督那里”。
因我活着就是基督，我死了就有益处。但我在肉身活着，若成就我工夫的果子，我就不知道该挑选什么。我正在两难之间，情愿离世与基督同在，因为这是好得无比的。 腓1章21-24节
我们坦然无惧，是更愿意离开身体与主同住。 林后5章8节
使徒保罗更愿意在“死亡”和“肉身存活”之中，选择死亡即离开肉身与主同住。因为他确信离开肉身后，会立即在天国与基督同住。
灵魂离开身体可以单独存在，离开灵魂的身体是死的，这事实是告诉我们，生命的本质并不是肉体而是灵魂。因此使徒们把人的肉体比喻为灵魂暂时居住的帐幕（彼后1章13-14节，林后5章1-4节），盼望不是这地上的暂时的生活，而是天国永远的生活而走了福音之路。
新约时代之所以如此参透灵魂的问题，是因为基督莅临这世亲自教导了这些。这末后时代再临基督安商洪来临，向那些过着虚空人生的人类，通过圣经告知了灵魂的存在和灵的世界。无论是谁，只要聆听这教导，都将会走向灵魂的故乡天国。