有關人類靈魂的課題，是在全世界引起眾多討論的神學議題。雖然除了基督教，其他許多宗教也在研究靈魂，並各自作出不同的解釋，但是始終找不到沒有矛盾、體系完整、毋庸置疑、值得相信的論文或講道。
我們在聖經裡能找到有關靈魂問題的答案，因為聖經是創造人類靈魂的創造主上帝的記錄。那麼關於靈魂，聖經是怎樣記錄的呢？基督來到這地上以前記錄的舊約聖經，就像夜晚的月光一樣，模糊地照射有關靈魂的真理。相反，新約聖經就像照亮天空的陽光一樣，透徹地揭示了靈魂問題。
靈魂是肉體的生命或動力嗎？
有些人只執著於舊約聖經的話語，因此曲解了靈魂問題。他們主張靈魂是肉體的生命或動力，因此人死後，靈魂也一同被消滅。但是聖經的教導卻有所不同。
耶和華上帝用地上的塵土造人，將生氣吹在他鼻孔裡，他就成了有靈的活人，名叫亞當。 創2章7節
人是由塵土和生氣，即肉體和靈魂創造的。需要注意的是，靈魂並不是與肉體同時被創造的，而是上帝另外吹進去的。因此當人死亡時，肉體歸土；靈魂歸於上帝（傳12章7節）。因為來的地方不同，回去的地方也不同。
如果靈魂只是肉體的生命或動力，就會得出以下結論：賜予肉身生命的肉身父母，也能賜予靈魂。但是聖經明確見證，我們不僅有「肉身的父親」，也有「屬靈的父親」。
再者，我們曾有生身的父管教我們，我們尚且敬重他；何況萬靈的父，我們豈不更當順服他得生嗎？ 來12章9節
靈的父親是指上帝。靈魂是上帝創造的，與肉身的父親無關。因此，聖經見證的靈魂並不是肉身出生時產生的，也不是肉體的生命或動力，而是人死後也依然活著的存在。
即使肉體死亡，靈魂也依然存在
耶穌教導我們，人能殺肉體，卻不能殺靈魂。
那殺身體不能殺靈魂的，不要怕他們；惟有能把身體和靈魂都滅在地獄裡的，正要怕他。 太10章28節
約翰和彼得等領受耶穌教導的使徒，也記錄了肉體死後靈魂依然存在。
……我看見在祭壇底下，有為上帝的道並為作見證被殺之人的靈魂，大聲喊著說…… 啟6章9-11節
他藉這靈曾去傳道給那些在監獄裡的靈聽，就是那從前在挪亞預備方舟、上帝容忍等待的時候，不信從的人……為此，就是死人也曾有福音傳給他們，要叫他們的肉體按著人受審判，他們的靈性卻靠上帝活著。 彼前3章19-20節、4章6節
使徒約翰通過啟示,看到殉教聖徒的靈魂與上帝對話。使徒彼得記錄，耶穌向在挪亞時代因洪水死去之人的靈魂傳播福音。有些人認為，死人的靈魂處於無意識狀態，但這並不是事實。聖經記錄耶穌向死人的靈魂傳播福音，表明了人死後靈魂依然存在、具有意識，能夠領悟和領受福音。
靈魂是生命的本質
聖經中肉身的死亡，意味著肉體和靈魂的分離（傳12章1-7節）。如果靈魂離開肉體，肉體就會死亡；相反，如果曾離開身體的靈魂回來，肉體就會活過來。生命的本質並不在於肉體，而是在於靈魂。
……有人從管會堂的家裡來，說：“你的女兒死了。”……耶穌說：“不要哭！她不是死了，是睡著了。”……耶穌拉著她的手，呼叫說：“女兒，起來吧！”她的靈魂便回來，她就立刻起來了。耶穌吩咐給她東西吃。 路8章49-55節
像這樣，人的靈魂既可以體內，也可以離開身體，存在於身體之外。換句話說，靈魂是不受肉體局限的獨立存在。使徒保羅也曾兩次提到，靈魂離開身體也能存活（林後12章2-3節）。此外，他還見證聖徒的死亡意味著「離開身體去基督那裡」。
因我活著就是基督，我死了就有益處。但我在肉身活著，若成就我工夫的果子，我就不知道該挑選什麼。我正在兩難之間，情願離世與基督同在，因為這是好得無比的…… 腓1章21-24節
我們坦然無懼，是更願意離開身體與主同住。 林後5章8節
使徒保羅說，在「死亡」和「在肉身活著」之中，更願意選擇死亡，即離開肉身與主同住。因為他確信，離開肉身後會立即在天國與基督同住。靈魂離開身體能夠單獨存在；而靈魂離開後，身體就會死亡。這告訴我們，生命的本質不在於肉體，而是在於靈魂。因此，使徒將人的肉體比喻為靈魂暫時居住的帳幕（彼後1章13-14節，林後5章1-4節），他們心中沒有對世上人生的盼望，而是仰望著天國永遠的生活，走了福音之路。
在新約時代，之所以能夠參透靈魂問題，是因為基督蒞臨於世親自給予了教導。在這末後時代，再臨基督安商洪蒞臨，通過聖經向過著虛無枉然人生的人類傳達了靈魂的存在和靈的世界。任何人只要側耳傾聽其教導，都可以走向靈魂的故鄉天國。